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JOBIM 2012
Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques
3 - 6 juillet 2012
Comme c'est la tradition à Jobim,
un second appel à communications est lancé, concernant les posters uniquement ("résumés courts").
La date limite de soumission pour ce second appel est le :
Mercredi 23 mai 2012
Les thématiques couvertes sont les mêmes que celles du premier appel à communications. Ces résumés seront examinés afin d'éliminer tout hors-sujet et en cas d'acceptation directement inclus dans les actes pourvu qu'ils respectent les instructions de formatage disponibles sur la page de soumission http://jobim2012.inria.fr/soumissions.htm de Jobim2012.
En espérant vous voir bientôt à Rennes (les inscriptions sont ouvertes à partir de la page http://jobim2012.inria.fr/inscriptions.html),
Pour le comité de programme et d'organisation de Jobim2012,
François Coste, Denis Tagu, Pierre Peterlongo et Claire Lemaitre
Appel à communications
JOBIM est une conférence ouverte à toutes les personnes travaillant aux frontières de la biologie, de l'informatique, des mathématiques et de la physique et s'intéressant à l'analyse, la comparaison et l'exploitation des données génomiques et post-génomiques. Ces journées, placées sous l'égide de la Société Française de Bio-Informatique, se veulent un lieu de rencontre annuel pour la communauté francophone des biologistes / informaticiens / mathématiciens, ceci dans un cadre agréable favorisant les échanges.
La treizième édition de ces rencontres, Jobim 2012, est organisée à Rennes du 3 au 6 juillet 2012 (en même temps que le festival Les Tombées de la Nuit...).
Cette année, trois types de soumissions sont possibles :
article original (8 à 10 pages), réservé aux résultats non publiés
résumé étendu (2 à 8 pages), pour la présentation de résultats récents, éventuellement déjà soumis ou acceptés ailleurs
résumé court (1 à 2 pages), concernant des travaux récents ou en cours, publiés ou non
Les articles originaux et résumés étendus seront sélectionnés sur la base de la lecture par au moins deux membres du comité de programme pour être publiés dans les actes de la conférence et pour faire l'objet d'une présentation orale (et, si souhaité par les auteurs, d'une présentation poster). Les résumés courts sont destinés à être présentés en poster. Les contributions pourront être en français ou en anglais. Les instructions de soumission sont disponibles sur la page soumission du site de la conférence http://jobim2012.inria.fr/.
JOBIM 2012 comportera des sessions plénières, ainsi que des sessions thématiques parallèles afin d'augmenter significativement le nombre de présentations et de rendre les assemblées moins formelles, favorisant ainsi les discussions. Le choix des thématiques sera effectué à postériori pour offrir un programme équilibré sur la base des contributions sélectionnées. L'existence d'une session parallèle sur un thème précis est par conséquent conditionnée par la soumission d'un nombre suffisant d'articles sur ce thème et si vous voulez que votre domaine soit bien représenté, il est important de soumettre largement vos travaux et d'inciter vos collègues à en faire autant...
Nous encourageons tout particulièrement les étudiants en thèse et les post-doctorants à venir présenter leurs résultats à JOBIM. Des prix à destination de ces jeunes chercheurs seront décernés pour la meilleure présentation sur poster et pour la meilleure présentation orale.
Les thèmes abordés par JOBIM couvrent le spectre de la bioinformatique au sens large. Cela comprend à la fois les aspects méthodologiques en amont (modélisation mathématique, informatique, statistique, physique), les outils logiciels et des contributions plus appliquées, allant jusqu'à l'établissement de nouveaux résultats en biologie. Sans être exhaustif, on peut citer les domaines suivants :
génomique, génomique comparative et métagénomique
évolution et phylogénie
biodiversité, génétique et génomique des populations
analyse des séquences et recherche de motifs
cartographie et annotation des génomes
biologie des systèmes et réseaux biologiques
structures des macromolécules
protéomique et interactions
expression des gènes, génomique fonctionnelle
analyse de données de grand séquençage
ARN non codants
épigénétique et épigénomique
ontologies, bases de données, intégration de données
algorithmique et statistiques pour la bioinformatique
etc.
Dates importantes
1er février : ouverture des soumissions d'articles
18 mars : fin des soumissions d'articles
27 avril : notifications aux auteurs
23 mai : version définitive des articles
23 mai : fin des soumissions du second appel à posters
3 au 6 juillet : conférence
Conférenciers invités
David B. Searls, University of Pennsylvania
Hugues Roest Crollius, Ecole Normale Supérieure
Pierre Baldi, University of California in Irvine
Ivo Hofacker, Institute for Theoretical Chemistry
Toni Gabaldon, Centre for Genomic Regulation
Martin Vingron, Max Planck Institute for Molecular Genetics
Bertil Schmidt, Johannes Gutenberg University Mainz
Pour le comité de programme et d'organisation de Jobim2012,
François Coste, Denis Tagu, Claire Lemaitre et Pierre Peterlongo